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La cellule bioinformatique de l'INRA

 

Contexte général

 

La rapidité et l’ampleur des évolutions technologiques d’acquisition de données dans les domaines de la biologie moléculaire et cellulaire, notamment de la génomique et de la post-génomique, suscitent un fort besoin méthodologique en informatique et en mathématiques appliquées, aussi bien sous l’angle de l’intégration des données que sous ceux de leur analyse et du développement de nouveaux algorithmes et modèles. Les besoins en bioinformatique concernent donc aussi bien le développement logiciel et l’organisation de l’accès aux données et ressources existantes que la recherche en bioinformatique et la diffusion de ses méthodes.

Contexte à l'INRA

Ce défi majeur est transversal à plusieurs départements de l’INRA. Il motive donc non seulement des recrutements dans chacun des départements concernés, mais aussi la mise en place d’actions de coordination (par exemple, la création de bases de données ou de plates-formes bioinformatiques ouvertes et partagées) et le renforcement de collaborations avec le département MIA comme avec des structures externes à l’INRA (AgroParisTech, CNRS, INRIA, Universités, etc.). En effet, dans la plupart des cas, l’échelle pertinente pour répondre à ces enjeux n’est pas le département mais l’INRA considéré dans sa globalité et avec son réseau de partenariat scientifique.

Afin de répondre à ce défi, c’est-à-dire de disposer d’une capacité collective de veille, de prospective et de propositions, le Collège de direction met en place une « Cellule Bioinformatique », qui reprendra et amplifiera les activités menées antérieurement par les cellules bioinformatiques dédiées à l’animal et au végétal, et qui travaillera avec, et au bénéfice de, l’ensemble des départements, structures et directions concernés.

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